2019年10月10日，国际知名期刊Nucleic Acids Research（生物1区，IF：11.147）在线发表了来自北京林业大学林木分子设计育种高精尖创新中心、中国科学院北京基因组研究所、北京大学和南方科技大学共同完成的3.0版植物叶片衰老数据库论文“LSD 3.0: a comprehensive resource for the leaf senescence research community”，是植物衰老研究领域具有重要参考价值的数据平台。
植物叶片衰老受到各种复杂外源环境信号、内源植物激素以及叶片年龄等因素的影响和有序时空调控，是重要的发育生物学过程。在正常生长条件下，叶龄是触发叶片衰老的主要因子之一，继而引起衰老相关基因SAGs（senescence-associated genes）的表达，调控叶片衰老进程。虽然已经有大量的研究涉及到叶片衰老调控研究，但这些信息都散落在文献中，不利于系统研究。为此，于2011年构建了第一版植物衰老数据库LSD，收集了21个物种的1145个基因，对这些基因提供了详细的功能注释、miRNA调控、蛋白互作以及突变体信息（Nucleic Acids Research, 2011, 39, D1103-1107）。2014年对数据库进行了升级LSD2.0，收集了44个物种的5356个基因和324个突变体（Nucleic Acids Research, 2014, 42, D1200-1205）。近五年来，国内外叶片衰老研究突飞猛进，鉴定出大量的SAG基因和突变体，并且揭示了新的调控机制如表观遗传调控等。升级的LSD3.0数据库收集了68个物种的5853个基因以及617个突变体的相关信息，并且整合了生态型 （ecotypes）的叶片衰老信息。
该论文第一署名单位为北京林业大学林木分子设计育种高精尖创新中心，青年研究员李中海和北京基因研究所博士生张阳为论文共同第一作者，李中海与北京基因组研究所研究员章张为共同通讯作者。高精尖中心首席科学家郭红卫教授和PI夏新莉教授，中心的博士后王厚领和张易也参与了论文部分工作，该项目受到国家自然科学基金及中科院前沿科学重点研究计划等基金资助，以及高精尖中心启动资金的支持。
论文链接：https://doi.org/10.1093/nar/gkz898
叶片衰老数据库网站链接：https://bigd.big.ac.cn/lsd/
参考文献
Li, Z., Zhang, Y., Zou, D., Zhao, Y., Wang, H.L., Zhang, Y., Xia, X., Luo, J., Guo, H. and Zhang, Z. (2019) LSD 3.0: a comprehensive resource for the leaf senescence research community. Nucleic Acids Res. https://doi.org/10.1093/nar/gkz898.
Li, Z., Zhao, Y., Liu, X., Jiang, Z., Peng, J., Jin, J., Guo, H. and Luo, J. (2017) Construction of the Leaf Senescence Database and Functional Assessment of Senescence-Associated Genes. Methods Mol Biol, 1533, 315-333.
Li, Z., Zhao, Y., Liu, X., Peng, J., Guo, H. and Luo, J. (2014) LSD 2.0: an update of the leaf senescence database. Nucleic Acids Res, 42, D1200-1205.
Liu, X., Li, Z., Jiang, Z., Zhao, Y., Peng, J., Jin, J., Guo, H. and Luo, J. (2011) LSD: a leaf senescence database. Nucleic Acids Res, 39, D1103-1107.
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